HSYLC引进原汁原味的哈佛大学本科“新生超小型课堂（Freshman Seminar）”的授课形式。在这里，中国高中生们在哈佛授课人的带领下，亲身体验一种与传统课堂截然不同的学习方式：平均人数在12人以下的超小课堂，却配有一名哈佛授课人和一名中国顶尖大学的助教授课；没有了遵循课本按部就班的讲授，每个学生却必须在课前阅读大量英文原版材料，带着自己的观点和问题加入课堂讨论；没有了讲台上下的距离，取而代之的是授课人和学生圆桌讨论中热烈的思维碰撞。正是这样的课堂，让许多峰会与会者第一次体会到想用>英语>(精品课)表达自己的冲动与喜悦；在训练与会高中生的英语语言表达能力同时，也同时鼓励他们独立思考、挑战权威知识的意识，在过去的几年里，超小型课堂已成为参加峰会的高中生们最喜爱和珍视的峰会传统之一。相当多的高中生一直到峰会结束后几年，都与他们的哈佛授课老师保持联系，在高中和大学阶段得到宝贵的建议。
峰会的课程选择使用大学式网上选课系统。几十名来自哈佛大学的授课人，每年从哈佛大学数千门包罗万象的课程中选择最适合中国高中生的话题，将几十门妙趣横生、涉猎广泛的课程带到中国。课程分成四大核心类目：“经济与发展”、“科学与技术“、“人文艺术”、“历史与社会学科”。每个学生将从四个类目下的几十门课程中自主选课，每个类目都提供近十门的课程供选择。
历届峰会丰富多彩的课题包括：“博弈论”、“人脑与电脑”、“社会心理学”、“巧克力的历史与人文含义”、“如何成为篮球经理”、“全球化”……哈佛授课人从历史、经济、科学、文学、人类学等多种学术角度出发，努力向学生呈现一种兼容并包的学术理念。在拓宽视野的同时，HSYLC的学生更将培养一种全新的思维方法和学习习惯，其中合作调研、批判性思考、辩论反馈等等都是重要的课堂形式。
值得一提的是，除了这些超小型课堂外，许多非核心课程将以课外活动的形式贯穿于峰会，例如曾开设的基础第二>外语>(课程)（西班牙语，法语等），美国最受欢迎的飞盘、垒球运动入门，爵士舞等等。
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